Studi In-Silico Ekstrak Dalam Tanaman Ranti (Solanum nigrum) Sebagai Inhibitor Jak2 pada Penyakit Leukemia Limfoblastik

Christine Christine, Fathia Pebriani, Muhammad Ariq Al Faruq, Carla Florencia, Muchtaridi Muchtaridi

Abstrak


Leukemia Limfoblastik Akut (LLA) merupakan penyakit hematologi heterogen yang ditandai dengan proliferasi sel limfoid imatur di sumsum tulang, darah tepi, dan organ lainnya karena adanya mutasi pada reseptor JAK. Beberapa tahun terakhir, strategi baru yang menargetkan protein terkait penyakit untuk degradasi seperti Proteolysis targeting chimerics (PROTAC) diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk studi in silico aktivitas senyawa penghambat STAT 3 dan JAK 2 pada tanaman ranti (Solanum nigrum L.). Pengujian dilakukan menggunakan perangkat lunak meliputi, ChemOffice 2019, AutoDockTools 1.5.6., BIOVIA Discovery Studio 2021, dan Ligandscout.  Dari 17 senyawa tanaman ranti yang diuji, hanya 11 senyawa yang memenuhi aturan Lipinski rules of five dan prediksi ADMETOKS yang kemudian dilanjutkan dengan penambatan molekul. Hasilnya, senyawa N-Acetyl-L-tryptophan ethyl ester dinilai paling berpotensi sebagai antikanker, meskipun memiliki energi gibbs yang lebih rendah sebesar -6.38 kcal/mol apabila dibandingkan dengan ligan alaminya yakni -8.19 kcal/mol. Hasil menunjukkan tanaman ranti (Solanum nigrum L.) berpotensi sebagai kandidat pengobatan LLA, namun masih butuh penelitian lebih lanjut dengan perangkat lunak yang lebih lengkap.

Kata Kunci


Leukimia Limfoblastik Akut (LLA), ranti, lipinski rules of five, ADMETOKS, penambatan molekul

Teks Lengkap:

PDF

Referensi


Buckley, D. L., Raina, K., Darricarrere, N., Hines, J., Gustafson, J. L., Smith, I. E., et al. (2015). HaloPROTACS: Use of Small Molecule PROTACs to Induce Degradation of HaloTag Fusion Proteins. ACS Chem. Biol. 10, 1831–1837. doi:10.1021/acschembio.5b00442

Dong, J., Qin, Z., Zhang, W.-D., Cheng, G., Yehuda, A. G., Ashby, C. R., et al. (2020). Medicinal Chemistry Strategies to Discover P-Glycoprotein Inhibitors: An Update. Drug Resist. Updates. 49, 100681. doi:10.1016/j.drup.2020.100681

Kregel, S., Wang, C., Han, X., Xiao, L., Fernandez-Salas, E., Bawa, P., et al. (2020). Androgen Receptor Degraders Overcome Common Resistance Mechanisms Developed during Prostate Cancer Treatment. Neoplasia. 22, 111–119. doi:10.1016/j.neo.2019.12.003

Mardianingrum, R., Herlina, T., & Supratman, U. 2015. Isolasi dan Molecular Docking Senyawa 6,7-Dihidro-17-Hidroksierisotrin dari Daun Dadap Belendung (Erythrina poeppigiana) terhadap Aktivitas Sitotoksik Antikanker Payudara MCF-7. Jurnal Chimica et Natura Acta. 3(3). 90-93

Pollastri, M. P. 2010. Overview on the Rule of Five. Current Protocols in Pharmacology. 49: 9.12.1-9.12.8.

Potjewyd, F., Turner, A.-M. W., Beri, J., Rectenwald, J. M., Norris-Drouin, J. L., Cholensky, S. H., et al. (2020). Degradation of Polycomb Repressive Complex 2 with an EED-Targeted Bivalent Chemical Degrader. Cel Chem. Biol. 27, 47–56. doi:10.1016/j.chembiol.2019.11.006

Sun, X., and Rao, Y. (2020). PROTACs as Potential Therapeutic Agents for Cancer Drug Resistance. Biochemistry. 59, 240–249. doi:10.1021/acs.biochem.9b00848

Toure, M., and Crews, C. M. (2016). Small-Molecule PROTACS: New Approaches to Protein Degradation. Angew. Chem. Int. Ed. 55, 1966–1973. doi:10.1002/anie.201507978

Vollmer, S., Cunoosamy, D., Lv, H., Feng, H., Li, X., Nan, Z., et al. (2020). Design, Synthesis, and Biological Evaluation of MEK PROTACs. J. Med. Chem. 63, 157–162. doi:10.1021/acs.jmedchem.9b00810

Wang, L., Zhang, J., Wan, L., Zhou, X., Wang, Z., and Wei, W. (2015). Targeting Cdc20 as a Novel Cancer Therapeutic Strategy. Pharmacol. Ther. 151, 141–151. doi:10.1016/j.pharmthera.2015.04.002

Xu, J. L., Yuan, L., Tang, Y. C., Xu, Z. Y., Xu, H. D., Cheng, X. D., et al. (2020). The Role of Autophagy in Gastric Cancer Chemoresistance: Friend or Foe?. Front. Cel Dev Biol 8, 621428. doi:10.3389/fcell.2020.621428

Zhang, X., Thummuri, D., He, Y., Liu, X., Zhang, P., Zhou, D., et al. (2019). Utilizing PROTAC Technology to Address the On-Target Platelet Toxicity Associated with Inhibition of BCL-XL. Chem. Commun. 55, 14765–14768. doi:10.1039/c9cc07217a




DOI: https://doi.org/10.24198/ijbp.v2i1.38126

DOI (PDF): https://doi.org/10.24198/ijbp.v2i1.38126.g17466

Refbacks

  • Saat ini tidak ada refbacks.


##submission.license.cc.by-nc4.footer##

IJBP by Universitas Padjadjaran is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License