Kajian In Silico Senyawa Turunan Flavonoid Terhadap ER-α Sebagai Antikanker Payudara

Deden Indra Dinata; Fauzan Z. Muttaqin; Jajang J. Sodik; Abdul M. Irfani

doi:10.24198/ijpst.v12i0.60035

Kajian In Silico Senyawa Turunan Flavonoid Terhadap ER-α Sebagai Antikanker Payudara

Deden Indra Dinata, Fauzan Z. Muttaqin, Jajang J. Sodik, Abdul M. Irfani

Abstrak

Di Indonesia, terdapat 65.858 kasus kanker payudara dengan angka kematian 22.430 jiwa. Pengobatan lini pertama kanker payudara melibatkan penggunaan Selective Estrogen Receptor Modulators (SERM), salah satunya adalah Tamoxifen. Turunan flavonoid telah terbukti secara farmakologi efektif dalam pengobatan kanker dan dapat menginduksi apoptosis sel. Penelitian dilakukan terhadap 103 turunan flavonoid menggunakan metode simulasi molecular docking dan dinamika molekul dengan Autodock versi 4.2.3, dengan parameter observasi Ki dan ∆G, sedangkan simulasi dinamika molekul menggunakan aplikasi AMBER 18 dengan parameter RMSD, RMSF, dan MMGBSA serta ikatan hidrogen. Berdasarkan hasil penambatan molekuler, senyawa scutellarein, maritimin, baicalein, maesopsin, formononetin, calycosin, pratensein, biochanin A, sulfuretin, dan eriodyctiol menunjukkan potensi sebagai antagonis ERα dengan nilai Ki yang lebih baik dibandingkan ligan alami. Berdasarkan parameter simulasi dinamika molekul, stabilitas pengikatan dan aktivitas antagonis dari turunan flavonoid ini terhadap ERα sebanding namun sedikit lebih rendah dibandingkan tamoxifen. Analisis simulasi dinamika molekul mengungkapkan bahwa meskipun senyawa flavonoid ini menunjukkan nilai Ki yang menjanjikan, stabilitas interaksi keseluruhan senyawa-senyawa ini dengan ERα kurang menguntungkan dibandingkan tamoxifen, seperti yang ditunjukkan oleh parameter dinamika molekul gabungan.

Kata Kunci

Dinamika molekul; ER-α; flavonoid; penambatan molekul; tamoxifen

Teks Lengkap:

PDF

Referensi

WHO. The Global Cancer Observatory - All cancers. Int Agency Res Cancer - WHO [Internet]. 2020 [cited 2024 Dec 21];419:199–200. Available from: https://gco.iarc. fr/today/home

Burhan A, Aisyah AN, Awaluddin A, Zulham Z, Taebe B, Gafur A. Uji aktivitas antioksidan dan antikanker ekstrak batang murbei (Morus alba L.) terhadap sel kanker WiDr secara in vitro. Kartika: Jurnal Ilmu Farmasi. 2019;7(1):17.

Fatimah F, Martha RD, Kusumawati A. Deteksi dan identifikasi senyawa flavonoid ekstrak etanol kulit batang tanaman majapahit (Crescentia cujete) dengan LCMS. CHEESA: Chem Eng Res Artic. 2020;3(2):88–98.

Reynaldi MA, Setiawansyah A. Potensi anti-kanker payudara tanaman songga (Strychnos lucida R.Br): tinjauan interaksi molekuler terhadap reseptor estrogen-α in silico. Sasambo J Pharm. 2022;3(1):30–5.

Dinata DI, Peni MI, Asnawi A. Identification of angiotensin receptor blocker II ligands from Gotu Kola (Centella asiatica L.) extract: an in silico study. J Sains Seni ITS. 2023;6(1):51–66.

Fauzi FM, Wutsqa YU, Rohmatika NA. Studi bioavalibilitas dan molecular docking senyawa fenolik Ocimum sanctum L. sebagai inhibitor reseptor estrogen alfa pada sel kanker payudara. Akfarindo. 2024;9(1):49–56.

Rastini, Giantari, Adnyani, Laksmiani. Molecular docking aktivitas antikanker dari kuersetin terhadap kanker payudara secara in silico. 2019;243–70.

Rodríguez-García C, Sánchez-Quesada C, Gaforio JJ. Dietary flavonoids as cancer chemopreventive agents: an updated review of human studies. Antioxidants. 2019;8(5):1–23.

Chirumbolo S, Bjørklund G, Lysiuk R, Vella A, Lenchyk L, Upyr T. Targeting cancer with phytochemicals via their fine-tuning of the cell survival signaling pathways. Int J Mol Sci. 2018;19(11).

Park S, Lim W, Bazer FW, Song G. Naringenin suppresses growth of human placental choriocarcinoma via reactive oxygen species-mediated P38 and JNK MAPK pathways. Phytomedicine. 2018;50:238–46.

Muttaqin FZ. Molecular docking and molecular dynamic studies of stilbene derivative compounds as sirtuin-3 (Sirt3) histone deacetylase inhibitor on melanoma skin cancer and their toxicities prediction. J Pharmacopolium. 2019;2(2):112–21.

Panicker CY, Varghese HT, Manjula PS, Sarojini BK, Narayana B, War JA, et al. FT-IR, HOMO-LUMO, NBO, MEP analysis and molecular docking study of 3-Methyl4-{(E)-[4-(methylsulfanyl)-benzylidene]amino}1H-1,2,4triazole-5(4H)-thione. Spectrochim Acta A Mol Biomol Spectrosc. 2015;151:198–207.

Granchi C, Capecchi A, Del Frate G, Martinelli A, Macchia M, Minutolo F, et al. Development and validation of a docking-based virtual screening platform for the identification of new lactate dehydrogenase inhibitors. Molecules. 2015;20(5):8772–90.

Asnawi A, Febrina E, Aligita W, Yuliantini A, Arfan A. Penambatan molekul dan dinamika molekul beberapa fitokimia dari Acalypha indica L. sebagai inhibitor matriks metalloproteinase-9. J Sains Farm Klin. 2023;10(1):62–70.

Kalontong PK, Safithri M, Tarman K. Molecular docking of active compound of Spirulina platensis as TMPRSS2 inhibitor to prevent the SARS-COV-2 infection. J Pengolahan Hasil Perikanan Indones. 2022;25(2):253–67.

Chagas CM, Moss S, Alisaraie L. Drug metabolites and their effects on the development of adverse reactions: revisiting Lipinski’s Rule of Five. Int J Pharm. 2018;549(1–2):133–49.

Zubair MS, Maulana S, Mukaddas A. Penambatan molekuler dan simulasi dinamika molekuler senyawa dari genus Nigella terhadap penghambatan aktivitas enzim protease HIV-1. J Farmasi Galenika. 2020;6(1):132–40.

Rachmania AR, Supandi, Larasati AO. Analisis in-silico senyawa diterpenoid lakton herba sambiloto (Andrographis paniculata Nees) pada reseptor alphaglucosidase sebagai antidiabetes tipe II. Pharmacy. 2015;12(2):210–22.

Cardoso F, Costa A, Senkus E, Aapro M, André F, Barrios CH, et al. 3rd ESO-ESMO international consensus guidelines for advanced breast cancer (ABC 3). Annals of Oncology. 2017;28(1):16–33.

Dall GV, Britt KL. Estrogen effects on the mammary gland in early and late life and breast cancer risk. Front Oncol. 2017;7:1–10.

Abdjan MI, Aminah NS, Siswanto I, Kristanti AN, Takaya Y, Choudhary MI. Exploration of stilbenoid trimers as potential inhibitors of sirtuin1 enzyme using a molecular docking and molecular dynamics simulation approach. RSC Advances. 2021;11(31):19323–32.

Sari IW, Junaidin D, dan Pratiwi. Studi Molecular Docking Senyawa Flavonoid Herba Kumis Kucing (Orthosiphon stamineus B.) Pada Reseptor Α-Glukosidase Sebagai Antidiabetes Tipe 2. Jurnal Farmagazine. 2020;7(2):54-60.

DOI: https://doi.org/10.24198/ijpst.v12i0.60035